Когда часть команды, отправившаяся для исследования острова, была обращена Цирцеей в свиней, Одиссей отправился один к дому волшебницы и с помощью данного ему Гермесом чудесного растения победил чары богини, которая, признав в отважном госте героя, предложила ему остаться с нею на острове и разделить ее любовь. Одиссей склонился на предложение колдуньи, но прежде заставил ее поклясться, что она не замышляет против него ничего дурного, и вернуть человеческий образ его спутникам, обращенным в свиней.

Прожив год на острове в неге и довольстве, Одиссей, по настоянию товарищей, стал просить Цирцею отпустить их на родину и, получив согласие богини, отправился сперва, по ее совету, в область Аида, чтобы узнать от прорицателя Тиресия о предстоящих ему испытаниях. Получив от Тиресия желанные сведения, Одиссей вернулся на остров колдуньи Цирцеи и, предупрежденный ею об опасностях, которые ожидают его у острова Сирен, в проливе, где обитают Сцилла и Харибда, и на острове Тринакрии, пустился в дальнейшее плавание (Гомер, Одиссея, X 207-574). От Одиссея у Цирцеи родился сын Телегон (Гигин, Фабулы, 127). По другим сказаниям, от связи Цирцеи с Одиссеем, у нее родился сын Агрий, или Авсон, или Латин.

Миф о путешествии Ясона за золотым руном повествует о том, как Цирцея очищает Медею и Ясона от совершенного ими убийства брата Медеи Апсирта, но изгоняет их из своих владений (Аполлоний Родосский, IV 559- 572). Известны также два сказания о безнадежной любви Цирцеи к морскому богу Главку, которому волшебница отомстила тем, что силой своих чар обратила в чудовище его возлюбленную Сциллу, и к царю Авзонии, сыну Сатурна, Пику, который богиней был превращен в дятла. В конце концов колдунья Цирцея вышла замуж за старшего сына Одиссея и Пенелопы, Телемаха.